哪种ic50计算软件方法比较可信

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酪氨酸酶抑制剂IC50值的计算方法及其验证
优质期刊推荐11)除置摇床上低速振荡10min,使结晶物充分;加快溶解,效果亦可;或放入37度放孵箱15分钟溶;12)关于如何计算IC50方法有多种;(1)改良寇式法:lgIC50=Xm-I(P-(;(2)Bliss法:自己查阅书籍;(3)IC50计算软件,见下面附件;(4)自己用EXCEL做趋势线来求IC50,关于;(5)在线求IC50或EC50:;13)计算抑制率,
11)除置摇床上低速振荡10 min,使结晶物充分溶解外,可用枪头吹打,
加快溶解,效果亦可;或放入37度放孵箱15分钟溶解结晶。
12)关于如何计算IC50 方法有多种
(1)改良寇式法:lgIC50=Xm-I(P-(3-Pm-Pn)/4)
(2)Bliss法:自己查阅书籍
(3) IC50计算软件,见下面附件
(4)自己用EXCEL做趋势线来求IC50,关于LD50的方法与此相似!
(5)在线求IC50或EC50:
13)计算抑制率,公式[(对照-本底)-(给药-本底)]/(对照-本底)*100%.
MTT试验的一些细节问题
1.选择适当的细胞接种浓度。一般情况下,96孔培养板的一内贴壁细胞长满时约有105个细胞。但由于不同细胞贴壁后面积差异很大,因此,在进行MTT试验前,要进行预实验检测其贴壁率、倍增时间以及不同接种细胞
数条件下的生长曲线,确定试验中每孔的接种细胞数和培养时间,以保证培养终止致细胞过满。这样,才能保证MTT结晶形成酌量与细胞数呈的线
性关系。否则细胞数太多敏感性降低,太少观察不到差异。
2.药物浓度的设定。一定要多看文献,参考别人的结果再定个比较大的范围先初筛。根据自己初筛的结果缩小浓度和时间范围再细筛。切记!否则,
可能你用的时间和浓度根本不是药物的有效浓度和时间。
3. 时间点的设定。在不同时间点的测定OD值,输入excel表,最后得到不同时间点的抑制率变化情况,画出变化的曲线,曲线什么时候变得平坦了(到了平台期)那个时间点应该就是最好的时间点(因为这个时候的细
胞增殖抑制表现的最明显)。
4.培养时间。200ul的培养液对于10的4~5次方的增殖期细胞来说,很难维持68h,如果营养不够的话,细胞会由增殖期渐渐趋向G0期而趋于
静止,影响结果,我们是在48h换液的。
5.MTT法只能测定细胞相对数和相对活力,不能测定细胞绝对数。做MTT时,尽量无菌操作,因为细菌也可以导致MTT比色OD值的升高。
6.理论未必都是对的。要根据自己的实际情况调整。
7.实验时应设置调零孔,对照孔,加药孔。调零孔加培养基、MTT、二甲基亚砜。对照孔和加药孔都要加细胞、培养液、MTT、二甲基亚砜,不同
的是对照孔加溶解药物的介质,而加药组加入不同浓度的药物。
8.避免血清干扰。用含15%胎牛血清培养液培养细胞时,高的血清物质会
影响试验孔的光吸收值。由于试验本底增加,会试验敏感性。因此,一般选小于10%胎牛血清的培养液进行。在呈色后,尽量吸净培养孔内残余培
(二)实验步骤
贴壁细胞:
1.收集对数期细胞,调整细胞悬液浓度,每孔加入100ul,铺板使待测细胞
调密度至孔,(边缘孔用无菌PBS填充)。
2.5%CO2,37℃孵育,至细胞单层铺满孔底(96孔平底板),加入浓度梯度的药物,原则上,细胞贴壁后即可加药,或两小时,或半天时间,但我们常在前一天下午铺板,次日上午加药.一般5-7个梯度,每孔100ul,设3-5个
复孔.建议设5个,否则难以反应真实情况
3.5%CO2,37℃孵育16-48小时,倒置显微镜下观察。
4.每孔加入20ulMTT溶液(5mg/ml,即0.5%MTT),继续培养4h。若药物与MTT能够反应,可先离心后弃去培养液,小心用PBS冲2-3遍后,
再加入含MTT的培养液。
5.终止培养,小心吸去孔内培养液。
6.每孔加入150ul二甲基亚砜,置摇床上低速振荡10min,使结晶物充分
溶解。在酶联免疫检测仪OD490nm处测量各孔的吸光值。
7.同时设置调零孔(培养基、MTT、二甲基亚砜),对照孔(细胞、相同浓
度的药物溶解介质、培养液、MTT、二甲基亚砜)
悬浮细胞:
1.收集对数期细胞,调节细胞悬液浓度1×106/ml,按次序将①补足的1640(无血清)培养基40ul ;②加Actinomycin D(有毒性)10ul用培养液稀释 l?g/ml,需预试寻找最佳稀释度,1:10-1:20);③需检测物10ul;④细胞悬液50ul(即5×104cell/孔),共100ul加入到96孔板(边缘孔用无菌
水填充)。每板设对照(加100?(储存液100 1640)。
2.置37℃,5%CO2孵育16-48小时,倒置显微镜下观察。
3.每孔加入10 ul MTT溶液(5 mg/ml,即0.5%MTT),继续培养4 h。(悬浮细胞推荐使用WST-1,培养4 h后可跳过步骤4),直接酶联免疫检测仪
OD570nm(630nm校准)测量各孔的吸光值)
4.离心(1000转x10min),小心吸掉上清,每孔加入100 ul二甲基亚砜,置摇床上低速振荡10 min,使结晶物充分溶解。在酶联免疫检测仪
OD570nm(630nm校准)测量各孔的吸光值。
5.同时设置调零孔(培养基、MTT、二甲基亚砜),对照孔(细胞、相同浓度的药物溶解介质、培养液、MTT、二甲基亚砜),每组设定3复孔。
(三)MTT的配制
MTT一般最好现用现配,过滤后4oC避光保存两周内有效,或配制成5mg/ml保存在-20度长期保存,避免反复冻融,最好小剂量分装,用避光袋或是黑纸、锡箔纸包住避光以免分解。我一般都把MTT粉分装在EP管
里,用的时候现配,直接往培养板中加,没必要一下子配那么多,尤其当
MTT变为灰绿色时就绝对不能再用了。
MTT有致癌性,用的时候小心,有条件最好带那种透明的簿膜手套.配成的MTT需要无菌,MTT对菌很敏感;往96孔板加时不避光也没有关系,毕
竟时间较短,或者你不放心的时候可以把操作台上的照明灯关掉. 配制MTT时用用PBS溶解,也有人用生理盐水配,60℃水浴助溶。
Na2HPO4 1.44g
KH2PO4 0.24g
(四)关于细胞的接种(铺板)
细胞过了30代以后就不要用了,因为状态不好了;培养板要用好的(最好进
口板),不好的板或重复利用的板只可做预实验。
接种时最好按照预实验摸索出的密度接种, 因为细胞密度在10000/ml左右时,所测得的OD值的区间即细胞抑制率(或者增值率)的所呈现的线性
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方法一:用寇氏改良法计算:
改良寇式法:lgIC50=Xm-I(P-(3-Pm-Pn)/4)
Xm:lg&最大剂量
I:lg(最大剂量/相临剂量)
P:阳性反应率之和
Pm:最大阳性反应率
Pn:最小阳性反应率
举个例子:各组浓度0.1、0.01、0.001、0.0001、0.00001、0.000001,稀释倍数为10,最大浓度为0.1,抑制率为0.95、&0.80、0.65、0.43、0.21,0.06。代入计算公式:
P=0.95+0.80+0.65+0.43+0.21+0.06=3.1
Xm=lg0.1=-1
lgI=lg0.1/0.01=1
lgIC50=-1-1*(3.1-(3-0.95-0.06)/4)=-3.6025
IC50=0.00025
方法二:SPSS计算法
&&&&运行SPsS&&进入SPSS数据编&辑器后,首先激活变量表(Variable
View)定义变量,&在变量名(name)下输入“剂量”、“动物数”和“死亡&数”,并将“剂量”的小数点位数(Decima1)设为“2”,&“动物数”和“死亡数”的小数点位数设为“0”。然后&进入数据表(Data
View),根据表头提示,依次输入&各组数据(见图1)。
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ALT="MTt法或者毒性试验&IC50计算方法"
TITLE="MTt法或者毒性试验&IC50计算方法" />
图一(备注:图片中数据位MTT数据,从左到右依次为药物浓度、阴性组-实验组吸光度、阴性组吸光度)
1.2参数选择
在数据表主菜单中,选择Analyze(分析)-"Regression(回归)--"
Probit,调出Probit
Analyze对话框,只需将“剂量”选人“Covariates”(协变量)栏中,“死亡数”选人“Response
frequen—&cy”(反应频率)栏中,“动物数”选人“Total
observed”(观察总值)栏中,在&“Transform”(转换)栏中,选择“log base
10”(logbit)(以10为底的对&数转换),其它保持默认选项(图2)。然后单击“OK”&钮即完成整个操作过程。
<img src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/data/attachment/album//fo277awx44tj1z.jpg" STYLE="word-wrap: break- max-width: 620"
ALT="MTt法或者毒性试验&IC50计算方法"
TITLE="MTt法或者毒性试验&IC50计算方法" />
完成上述操作,SPSS会自动显示全部分析结果&(SPSS
Viewer),其中包括:回归方程参数表(图3),不同剂量的实验值和预期值概率表(图4),从0.01到&0.99死亡率的剂量(包括0.50,即&&)及95%可信区间表。以及对数单位与概率单位的关系曲线。
可参考文献:用SPSS软件计算新药的LD50【药学进展&&2003年&第27卷&第5期】
方法三:origin拟合曲线
所需数据:剂量、吸光度平均值(MTT实验)
打开origin。一列输入&&剂量数据,一列输入吸光度平均值数据。如图:
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TITLE="MTt法或者毒性试验&IC50计算方法" />
然后点击【tool】-【sigmoidal】--在出现的对话框中选择【fit】即可,在右下角的结果中&&lgIC50所对应的数值极为IC50所对剂量。如图
<img src="/blog7style/images/common/sg_trans.gif" real_src ="/data/attachment/album//210838rtppebrsopyestbd.jpg" STYLE="word-wrap: break- max-width: 620"
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