华大基因无创dna基因检测方法是什么?

发布日期:2018-07-31字号调整14px浏览次数(2771)手机看新闻分享此篇文章()导读:华大基因再遭质疑:“无创DNA检查”后生下病儿,2017年9月3日,一个男婴降生在湖南省长沙市望城区妇幼保健院。不幸的是,他的出生伴随着“13号染色体长臂缺失综合征”、“脑发育不良”、“虹膜缺损”等一系列缺陷和疾病。这意味着,小男孩很可能会智力障碍、生长迟缓、外表异常,几乎无法正常长大。据多家媒体报道,湖南长沙一位“13号染色体长臂缺失综合征”的患儿母亲,在产前曾做华大无创基因检测,未能起到筛查作用,最终导致产妇生出带有生理缺陷的婴儿,且不予理赔,引发热议。产前筛查和产前诊断都有哪些方式?什么是无创产前DNA?唐氏筛查该怎么查?  1. 什么是唐氏综合征?  廖世秀主任:唐氏综合征是一种严重的出生缺陷,它的主要表现有严重的智力障碍,同时合并多个器官的发育异常,比方说:合并心脏畸形、合并消化道畸形、合并病尿道畸形等等,所以说它是一个综合征多系统多器官受累,它的智力低下是一种重度的智力低下的表现。  2. 唐氏筛查应该怎么查?目前有哪些方式?  廖世秀主任:唐氏综合征的产前筛查总共有三大类:第一是孕11周到13周+6(天)的产前超声筛查,就是NT筛查;第二个是孕15到20周+6(天)的普通唐氏筛查;第三个是孕12周到22周+6(天)的无创DNA筛查。既然是筛查肯定会筛出一些高风险的(孕妇),那这些高风险的孕妇不是一定有问题,只是风险高,所以说我们还要进一步确诊,我们就需要做羊水检查,羊水检查时间在河南省人民医院产前诊断中心一般是从16周到7个月,我们一般都做羊水检查。那么9周到15周我们做绒毛检查,7个月以后我们一般做脐带血检查,早期的绒毛检查、中期的羊水检查、还有中晚期的脐带血检查都是一种确诊的手段。  3. 什么是唐氏综合征产前筛选检查?  廖世秀主任:唐氏筛查顾名思义:我们就是筛查哪些胎儿罹患唐氏综合征的风险高,这个跟普通检查不一样,它主要是筛查孕妇所怀孕的胎儿是唐氏综合征或者是开放性神经管缺陷,这个风险高低的评估,如果是高风险的,我们要进一步进行确诊;如果是低风险的我们定期的进行常规的产检,这就是我们平时说的唐氏筛查。它和普通的产检不一样,普通的产检就是看孕妇怀孕期间,有没有妊娠合并症、有没有并发症,唐氏筛查主要是判断胎儿有没有唐氏综合征,它的风险是高还是低。唐氏综合征这个筛查是有时间窗口的,我们一般推荐是在怀孕15周到20周+6(天)这个时间窗口做唐氏筛查。目前唐氏筛查大部分都用四联筛查方案,四联筛查阳性检出率比以前的二联筛查和三联筛查有明显的提高,可以高达80%。它的优点就是:它查的出生缺陷的疾病谱很广,它可以查21-三体、18-三体、13-三体等染色体非整倍体,同时它还可以筛查一些体表结构的畸形:比方说无脑儿、开放性脊柱裂脑、脑膜膨出、脊膜膨出、内脏外翻等等,所以说它也是一个非常好的产前筛查方式。一般情况下,没有产前诊断指征的所有孕妇在这个时间窗口内都应该做唐氏筛查,那哪些人是有产前诊断指征的呢,比方说高龄、曾经生育过出生缺陷患儿的、有遗传病家族史的、父母双方有染色体异常的、彩超检查高度怀疑胎儿有问题的或者是孕期接触很多致畸因素的等等,就是怀疑孩子有出生缺陷 风险很高这一类人群,都是有产前诊断指征的,这就叫高危人群。除了这些高危人群,所有单胎的孕妇都应该进行唐氏筛查,双胎不太适合做这个唐氏筛查,一般建议直接做羊水检查。  4. 什么是无创DNA产前检测?  廖世秀主任:无创DNA检测就是我们老百姓口语化的一个说法,一般专业上我们叫孕妇外周血胎儿游离DNA检测,它就是抽孕妇的外周血分离出胎儿的游离DNA,然后进行高通量测序,进而分析胎儿罹患唐氏综合征的风险,这是无创DNA检测的定义。由于它是直接检测胎儿的DNA,所以说它筛查的结果阳性检出率明显提高,它能阳性检出率可以达到95%以上,但是它也有它的缺陷:比方说它只能筛查21三体、18三体和13三体,其它的出生缺陷目前临床上还不能筛查。检测的最佳时间我们一般推荐是在孕12周到22周+6(天),如果在12周之前,孕妇外周血中胎儿游离DNA浓度太低可能会影响检测结果;月份太大的话,检测出是高风险,可能进一步产前诊断的时间就没有了,所以说我们技术规范上规定的就是孕12周到22周+6(天)这个时间做为最佳时间来推荐无创DNA的检测。无创DNA的适宜人群  我们一般推荐三类人群:第一类人群就是普通唐氏筛查以后提示她的风险介于高风险和低风险之间就是临界高风险的人群,这一部分人群我们推荐她做一个无创DNA的检测,就是孕妇外周血胎儿游离DNA的检测,这是第一类;第二类就是她有产前诊断指征,比方说她36岁了应该做羊水(检查),但是她刚好有羊水检查的禁忌症,比方说有宫缩、腹痛、有活动期感染、有出血,不敢去做这种有创的产前诊断,  所以说我们也可以退而求其次推荐她做一个无创DNA检测,当然会要告诉她这只是一个筛查,如果还是高风险的话我们还是要进一步做羊水检查,这是第二类人群;第三类人群就是没有产前诊断指征,但是她过了普通唐筛的时间。刚刚我讲了我们唐筛的时间是15周到20周+6(天),那她现在22周了或者21周多了,我们也可以推荐她做一个无创DNA检测,所以说无创DNA检测目前我们临床上把它作为一个二线的筛查方案来用的。  5. 什么是羊水检查?  廖世秀主任:通过羊膜腔穿刺抽取羊水,然后再进行细胞培养或者基因检测,从而判断胎儿是某种出生缺陷或者遗传病的一种手段,羊水检查可以说是目前应用最广泛的一种产前诊断途径。常用途径有三类:一种就是孕早期的绒毛检查;一个是孕中期的羊水检查;再一个是中晚期的脐带血检查。羊水检查的时间段比较广,我们中心可以从孕16周到7个月都可以做羊水检查,如果羊水检查结果出现嵌合体的话,我们需要进一步地抽取脐带血做脐带血的检查。因为羊水里面的细胞是脱落的这种细胞,胎儿胎盘、羊膜、胎儿皮肤脱落的细胞,  脱落以后也有一些突变,它不像脐带血,脐带血里面是胎儿纯的细胞,所以说出现嵌合体的情况下,我们再做。一般情况下是直接做羊水(检查)就可以确诊的,羊水检查等这些侵入性的产前诊断手段,它最大的优点就是确诊,是唐氏综合征就是唐氏综合征,不是唐氏综合征就不是唐氏综合征,它是确诊,是就是不是就不是。当然产前诊断只是针对性的,怀疑某一种病我查某一种病,比如说我不是唐氏综合征不等于这个宝宝没有其它的出生缺陷,只是诊断他不是唐氏综合征或者是唐氏综合征,所以对唐氏综合征来说羊水检查是金标准。它是最后确诊的手段,任何筛查无论你风险多高,是普通唐氏筛查、是超声筛查或者是无创DNA检测提示高风险都不是确诊,只有羊水检查才是确诊。缺点就是孕妇和家属对这个检查感到很担心、很焦虑,就是有没有风险、会不会流产、会不会感染,就可能有这个担心,那实际上这个羊水检查是非常普遍的一种产前诊断方法。大部分产前诊断中心都做了几十年,有一些产前诊断中心从上世纪70年代就开始做,就是说从上世纪70年代就有羊水检查,所以说(羊水检查)是非常成熟的一种产前诊断方法。实际上它就是用中期的羊水就是胎儿的小便,所以说取一点胎儿的小便去化验,理论上对胎儿并没有什么影响,只是这个羊水在羊膜腔内,这个羊膜腔又在母亲的子宫内,所以说我要用一个很细的针在母亲的腹部扎一下,也不需要麻药,从针进去到拔出来二三十秒就OK了,还没有抽血痛,一般情况下都是比较安全的。  当然有一些孕妇,比方说她正在出血,那我们可能要把出血控制以后再做;或者她正在感染的活动期,可能要把感染控制以后再做,这样从而把风险降到最低,一般情况下是不会出现这种感染或者流产,这种发生概率非常低,大部分的产前诊断中心都是几千分之一,甚至上万分之一这种概率。  6. 专家解读产前筛查和产前诊断  廖世秀主任:所有的孕妇在怀孕以后都应该进行遗传咨询,在遗传咨询的时候,遗传医生就会告诉你你应该做哪种方式的产前筛查  是做普通唐筛还是做无创DNA还是直接做产前诊断。在做遗传咨询的时候我们的专业医生会根据你的病史、会根据你整个妊娠的情况以及你的家族史,做一个最科学的建议。如果是根据病史省问,你已经是高风险了,这一部分人群一般是会推荐直接做产前诊断。在孕早期我们做绒毛检查,把胎儿比作一棵树的话,这个绒毛就是树的根系;在孕中期是做羊水检查;羊水检查还是把胎儿比作一棵树的话,这棵树上掉下的树叶就是我羊水里面要收集的羊水细胞,这是羊水检查中期;到(孕)晚期我们可以做一个脐带血的检查,这是高危人群。一般我们遗传咨询大夫会给你一个产前诊断的建议,如果你是一个普通的孕妇没有任何高危因素,告诉你可能会做唐氏筛查,如果唐氏筛查高风险那我们再做进一步的产前诊断;如果是临界高风险那可能会推荐你做一个无创DNA的检测;如果是低风险那可以建议你做一个规范的常规的产前检查就产检。我们做羊水检查确诊为唐氏综合征,一般都会给一个诊断证明,拿着这一个诊断证明呢胎儿的父母商量以后,不想要这个宝宝可以做人工流产或者是引产,避免这种严重的缺陷患儿的出生。  本期专家  廖世秀  医学博士,全国产前诊断技术专家组成员,研究生导师,河南省遗传优生学术技术带头人、享受国务院特殊津贴,享受河南省政府津贴。  现任河南省医学遗传研究所所长,河南省人民医院产前诊断中心主任、遗传疾病科主任、医学遗传教研室主任、医学遗传住培基地主任;河南省遗传病功能基因重点实验室主任、河南省高通量测序技术工程实验室主任、河南省临床基因诊断与治疗工程实验室主任。  兼任中华医学会医学遗传学专业委员会常委、中国医师协会医学遗传专业分会常委、中国优生协会出生缺陷预防专业副主任委员、海峡两岸医药卫生协会遗传与生殖专业副主任委员、中国优生科学协会基因诊断专业分会常委、河南省医学遗传专业委员会主任委员等。兼任《中华医学遗传学杂志》、《中华实用诊断与治疗杂志》等多家杂志编委。  从事遗传优生及产前诊断工作20多年。专业特长为出生缺陷/遗传病的产前诊断及发病机制研究,复发性流产(习惯性流产)的病因研究与防治,遗传病的诊治及预防。  现主持国家自然科学基金项目3项、省部级科研课题6项,曾获省部级科研成果4项、国家级成果1项,发表学术论文70多篇;参与编写国家技术规范、指南等6部。扫描二维码,可用手机阅读此文章
腾讯《一线》作者 术荷今日虎嗅网发布《华大癌变》一文,将基因检测的风险放大到公众面前,据报道,华大基因主营业务无创产前DNA检测未能帮用户起到筛查作用,最终导致许多孕妈生出带有生理缺陷的儿童。虎嗅网报道指出,因受高商业利润驱动,华大基因及其代表的无创产前DNA筛查行业本身,诉诸孕妇“恐惧”,撬动整个医疗行业一起,逐渐放弃了一些传统筛查方法,比如唐筛、超声、羊水穿刺等,最终酝酿出悲剧。华大基因CEO尹烨今日回应腾讯《一线》称,“《华大癌变》一文中引用的案例较为复杂,不只是技术问题。”目前国内采用无创DNA检测的孕妇不在少数,一位做过相关检测的怀孕女士,向腾讯《一线》讲述了医院和基因检测企业的合作链条,以及孕妈们如何一步步从完全不了解到购买相关基因检测服务。以下是腾讯《一线》对其口述内容整理:我是一个正处孕中期的孕妈妈,在过去的几个月里做过两次DNA检查,检查的目的都是为了尽量确保胎儿没有问题。两个DNA检查合计花费6700元,不属医保范围内,不能报销。从孕妈的角度,如果这些检查对诊断腹中孩子的健康状况有实际作用,花这些钱是一点都不会心疼的。然而,今天虎嗅一篇《华大癌变》的文章,将基因检测中的风险放大到我面前,我不禁对自己做的两次基因检测的可靠性产生怀疑。作为一个没有接受过医学教育的人,我认为自己能做的就是充分信任医院和医生,对于一些自己无法辨别必要性的检查,如果医生说必要,那就做——为了孕育一个健康的宝宝,多付出一些经济上的代价没有问题。以下是我的检查经历:我在孕五周的时候第一次去某私立医院做了早孕检查,检查结果显示HCG数值正常,孕酮很低,加上此前有过出血症状,在确定是宫内孕后,医生诊断我为先兆流产,要求我静养休息,之后开始服药保胎。被诊断先兆流产后,家人觉得还是要去公立医院做检查更保险,因此又去了公立医院检查。在5-12周,我每周都去公立医院抽血、化验、查HCG和孕酮,监测身体的状况,并一直在服用黄体酮。那段时间心情很是焦虑,但焦虑也没用,那一阶段孕妇做不了什么,只能听医生的话,尽量静养,按时吃药,每周化验监测。为了了解更多,我在一些母婴社区买了很多课程,听妇产科的专家讲课,当时自己最为关注的问题就是早孕期间为什么会流产。根据专家们的解释,大体有几种原因:胎儿染色体异常或胎儿本身存在异常、免疫因素、感染因素、药物毒物因素。我当时最怕的就是胎儿染色体异常,因为这意味着这个胎儿即使保下来了也是没有用的,生下来对他对我们都是灾难。在这种心情下,我会寻求一切我能触达的渠道,来查明胎儿的健康状况。孕7周时,B超显示有胎心胎芽,说明胎儿在正常发育,稍微放了点心,医生确定预产期后,我便去该院妇产科的咨询室预约建档了(该院的建档流程是7周时拿有胎心胎芽的B超单预约建档,12周的时候做12周产检,让产科主任看检查结果,根据结果产科主任判断是否能够建档,就可以在该院正式建档)。在建档室,负责建档流程的护士第一次向我介绍了一项DNA检查项目:脆性X-FMR1基因Amplide产前筛查,和脊肌萎缩症-SMN1基因携带者筛查。这是我第一次听说这个DNA检查,在此之前从来没有听说过。介绍中,护士强调,即使夫妻双方身体健康,但也不能排除彼此携带了这些病变染色体,一旦携带了,就意味着胎儿可能会有染色体异常,会得病。护士还强调,这项检查是北医三院做的,我想北医三院妇产科的权威性大部分人都是知道的,当护士提到北医三院,我心中不由产生了一份信任感。根据护士介绍,我需要做的就是在这家医院抽几毫升血,然后血会快递给北医三院,由该院做检查、出报告。费用3500元,不在医保报销范围内。检查结果需要14个工作日,结果在网站上自己查询,如果有风险护士会打电话通知。我模糊的记得关于风险有一个具体的值,如果母亲的风险值是多少,会免费给父亲再做一次检测,如果夫妻双方都有风险,那就需要羊通过水穿刺做最终的诊断。第一次听护士介绍的我将信将疑,因为我和先生身体健康,每年都做体检没有任何异常,但是在先兆流产的阴影下,我个人倾向于做这个检查,先生则不置可否。孕8周时,我再一次去医院做检查,那一次就诊经历让我坚定了要做这项DNA检测的决心。当天候诊时,前面就诊的是一个年纪跟我相仿、但之前有过胎停育史的姑娘,我听见医生建议她,因为她此前有过不良孕史,做一个DNA检查更保险。这是我第一次从出诊的妇产科大夫那听到建议做DNA检测的建议,内心一惊,因为我已经被诊断了先兆流产,既然有风险因素就建议做检查,那我决定也要做检查。回家后我找相熟的朋友咨询了身边的妇产科大夫,那位朋友的建议是:建议做,而且据他了解这个检查在深圳是有补贴的,孕妇个人只要出800元就可以,总之是花钱买心安。所以到9周再去医院时,看完大夫后我就立刻去找小护士签合同、交钱了。刷完卡后,我第一次发现,交易的主体并不是北医三院,而是一家名叫“北京华诺奥美医学检验所有限公司”的商户,我问小护士这是怎么回事,小护士回答,华诺奥美和北医三院是合作关系,我们的血液样本都会送到北医三院的实验室去做检测,最后也是北医三院的实验室出结果。钱都已经交了,加上内心对公立医院本能的信任,我没有深究这件事,就去抽血了。在平稳的度过了最危险的早孕期后,有感于公立医院实在不美好的就诊体验,我最终还是坚持去私立医院做接下来的产检和分娩。孕12周,我回到了第一次做早孕检查的私立医院开始做正式产检,例行检查做完后带着结果看医生时,医生向我介绍了唐氏筛查与无创DNA两种方法,我需要选其一。因为在正常流程中,12周产检的下一次检查就要做唐筛了,因此我要提前确定选择哪一种筛查方式。在这里补充一点背景知识:唐氏筛查是唐氏综合征产前筛选检查的简称。目的是通过化验孕妇的血液,检测母体血清中甲型胎儿蛋白、绒毛促性腺激素和游离雌三醇的浓度,并结合孕妇的年龄、体重、孕周等方面来判断胎儿患先天愚型、神经管缺陷的危险系数。无创DNA则是在孕周的一定范围内,通过抽取孕妇的血液,从中对胎儿游离DNA进行检测,确定染色体异常风险。我在那家私立医院已经购买了产检分娩套餐,套餐中是包含了唐筛费用的。医生介绍,唐筛套内价格2000元,无创DNA价格2500元,在私立医院费用相差不大,但是在公立医院唐筛只要几百块,费用相差比较大。我如果选择做无创,需要额外交2500元,套内的唐筛价格在分娩之后会退还。在检测的范围、准确度和适用人群上,唐筛和无创DNA也有差别,大体来讲,无创DNA的准确度更高。我自己在网络上听过一些专家课程,因此对唐筛、无创DNA和羊水穿刺的关系也有了解。根据我了解到的情况:唐氏筛查的准确率在60%-70%,孕妈年龄大于35岁属于高风险,因为女性超过35岁排出异常卵子的风险会升高。唐筛的原理是通过检测孕妇身体的某些数值,综合孕妇的年龄、体重等因素,根据一个公式,计算出孕妇唐筛的风险程度。无创DNA的准确率在96-99%,无创DNA是通过检查孕妇血液中的胎儿游离DNA进行检测,因此准确率相对较高。但是唐筛和无创DNA都只是筛查手段,无法确诊胎儿是否有染色体异常,如果要确诊,唯一的方式是做羊水穿刺。网络课程中专家的说法是,通常来讲,大部分孕妇先做唐筛,如果唐筛结果提示是中、高风险,可以选择无创DNA做进一步检查,如果无创DNA结果还是提示高风险,就需要做羊水穿刺或者绒毛、脐带穿刺做进一步确诊。讲课的该位专家提到,无论是唐筛还是无创DNA都是筛查手段,只有羊水穿刺是确诊方法。但由于羊水穿刺有可能带来流产风险,所以通常都是先筛查,再根据风险程度决定要不要做羊水穿刺。同样,正因为唐筛和无创DNA都是筛查手段,所以即使检查结果显示是低风险,也不排除胎儿有染色体异常的可能。由于我自己提前对这些有一点了解,因此我直接选择了做无创DNA。出于好奇,我问了医生自己之前做过脆性X-FMR1基因Amplide产前筛查和脊肌萎缩症-SMN1基因携带者筛查,这个基因检查和无创DNA的关系是什么。医生表示自己也不太清楚。采无创DNA血样的当天,我在该私立医院的某间诊室见到了基因公司的人,我先问了对方是哪家公司的,对方表示是贝瑞和康的,之后开始跟我介绍他们的套餐。与医生说的不同,这位基因公司的工作人员表示,有两种无创DNA检测套餐,一种是医生说的2500元,只检测21、18和13号染色体;还有一种是在这三种染色体检查之外,再检查胎儿性染色体非整倍体疾病,包括45,X、47,XXX及47,XYY,以及7种相对高发的大于3Mb大小并位于特定的症候群相关染色体片段位置的微缺失疾病,价格3200元。该检测是与北京大学第一医院合作的实验室合作,由该实验室做检测并出检测结果,检测结果会发送到我的手机上,如果风险高基因公司会打电话联系,在他们的协调下做进一步的羊水穿刺确诊。再一次出于花钱买心安的想法,我选择了3200元的套餐,签完合同,基因公司的人拿出一份保单,说如果检查结果是高风险,保单赔付最高4000元的金额,用于孕妇进行下一步的羊水穿刺、染色体分析等检查。如果无创DNA检测结果为阴性或低风险,但被保险人的胎儿经省市级医院专科医生明确诊断患有检测范围内疾病并终止妊娠的,保险公司赔付2万人民币,同时对被保险人及其胎儿保险责任终止,被保险人不再向检测机构、投保单位、送检医院及保险公司追索任何其他费用。最重要的是,如果无创DNA检测结果是阴性或者低风险,但被保险人生育的孩子在出生一年之内被诊断患有检测范围内的疾病,保险公司赔付40万元,同时对被保险人及其胎儿保险责任终止,被保险人不再向检测机构、投保单位、送检医院及保险公司追索任何其他费用。听她这样介绍,我当时就有点发慌:如果生下来孩子有问题,你赔40万又有什么用呢?基因公司的人说:基本不会检错。我问:你们检错的概率是多大?她回答:据我所知,过去几年,我们没有一例检测错误的。话已至此,合同已签,我也没有更好的选择,还是在保单上签下了自己的名字。以上就是我两次孕前基因检查的大概经历。现在两个DNA检测的结果都已经出来了,第一个检测是我没有携带病变染色体,第二检测是我是低风险,所以单从检查结果来看,我想是可以放心。但今天看了虎嗅《华大癌变》的文章后,心中仍不免担心:万一我属于被检错的那1%的人群怎么办?对于任何一个家庭而言,生下一个有缺陷的孩子,都意味着是天大的打击。说实话,在看这篇文章之前,我并没有仔细的整理或回忆两次做DNA检测的经历,过程中遇到的一些疑惑,比如说介绍时说是北医三院检测但钱交给了基因检测公司,这其中各方的关系是什么,北医三院在其中的角色是什么;如果漏检、检错了,我该怎么办?这些问题此前我并没有深究过,但今天,我不得不仔细去思考基因检测的可靠性,对过程中医院、医生、基因公司、送检实验室的信息,有了更为强烈的知情需求。经历了一次产检后,我能感受到,就诊过程中,孕妇会不断的被推销各种检查项目,这些项目几乎都在医保范围外,单价都不便宜。而实际生活中,大部分孕妇由于缺少基本医学知识、对基因技术不了解,但出于对胎儿健康状况的关切,当护士或者医生放大或强调存在的风险时,都不会吝啬几千块钱,而选择做额外检查。我就是这样的孕妇,我不知道这些检查项目实际到底有无必要,但出于花钱买心安的心理,愿意多花几千块,尽一切可能去降低分娩出有问题宝宝的风险。说实话,我现在无法评价这些向孕妇推销产品的人,因为在检查有用的前提下,即使某些检查并无必要,做一次检查带来的只是金钱上的损失而已。但如果检查是无用的,那这些人就是在作恶——然而我并没有能力去判断检查到底是有用还是无用。我只希望,做基因检查的公司、推销基因检查的医院和医生能够意识到,当孕妇选择了你们的产品,就意味着她将筛查胎儿患病风险的信任交给了你们。为这些服务付出金钱是无可厚非的,但链条中的各方如为了利益,故意放大风险、回避责任,且不为检测的准确率和可靠性负责时,你们的私利和失误将会为一个家庭带来灭顶之灾,而当事故一再发生摧毁了孕妇对你们的信任后,最终,你们的也会为自己种下苦果。转自腾讯科技
2018 年 9 月 19 日~9 月 23 日 ,第二十一届全国临床肿瘤学大会暨 2018 年 CSCO 学术年会于厦门国际会议中心如期举行,本届大会的主题为「全力推进临床研究,谱写抗癌治疗新篇章」。会上,丁香园就大家关注的基因测序相关问题,对华大基因肿瘤事业部总监张晓平进行了专访。张晓平从基因测序的质量控制、到基因数据库建设、到未来发展畅想一一为我们做了精彩回答,现整理要点与大家共享。把握正确方向,提升质量控制近年来,随着测序技术的快速成熟,和肿瘤临床研究的积累,肿瘤基因测序这一块已变得越来越火热。但是新事物的飞速发展,行业规范在逐步建立过程中,常出现产品良莠不齐的市场混乱局面。如不加强、加快行业规范建设,势必影响肿瘤基因检测行业的健康发展。面对这种现象,张总从发展方向和质量控制这两点切入,为我们分享了宝贵经验,以期帮助相关机构、企业走到持续健康快速发展的轨道来。其一,关于发展方向。随着抗肿瘤机制研究的逐步深入,发现越来越多的抗肿瘤药物的靶点,相伴而生的这些作为肿瘤靶向用药的伴随诊断的需求就越来越多,原来只需要检测一个基因的几个位点到现在一个患者需要同时检测几个、几十个甚至几百个基因,原来的 PCR 检测技术和 Sanger 一代测序技术,早已不能满足临床日益增长的基因检测需求,在日新月异的肿瘤临床用药需求上,NGS(二代高通量测序技术)一次同时可以检测几百个甚至几万个基因,单基因的平均检测成本极低,这样 NGS 技术就显示出了明显的优势。因此,每个肿瘤患者基因变异的不同决定了每个患者需要精准诊断,才能精准治疗,所以,需要为每一个肿瘤患者进行全面的基因检测,来帮助医生准确确定治疗方案。采用 NGS,利用大数据,从整体上全面评估才应是未来的核心。张总表示,「华大基因的布局也是基于这一点」。其二,关于质量控制。质量控制是在医学诊断服务当中的重要性不言而喻,但同样,大家也都明白质量控制的难度。因为把某一次的结果做得很准确相对容易,而如果能持续的把所有的样本的结果做的都准确、可靠,那就非常难了。这要靠一个非常严谨的质量体系去保持,而且这个质量体系是要长期的、有效的。如何维持这一质量体系呢?对此,张总介绍了两点经验:第一,要建立完备的质量控制系统。因为要保证一个检测结果准确有效,从患者咨询开始,到采集样本,再到样本的运输保管以及检测,再到检测后的咨询这一整套的流程都需要一整套的质量控制系统来支持;第二,规范性很重要。以华大基因临床检验实验室为例,我们在基因测序领域里面是最早开始建立 NGS 的 ISO 质量控制系统和参加 NGS 国际室间质评项目的实验室,参考国际和国内的质量标准,很早就建立了非常完善的质量控制系统性的规范,上述整套流程里的每一个操作步骤都有严格的相关规范,形成受控的文件,操作人员严格遵守。中国人肿瘤大数据数据库的建立是大势所趋目前针对肿瘤患者的基因变异的解读数据库主要使用的是欧美人群的数据库,一方面因为肿瘤机制的研究欧美走得比较靠前,一方面肿瘤的创新药物的欧美国际大型制药企业投入大、研发成熟。而从欧美肺癌患者和中国肺癌患者的 EGFR 突变频率存在巨大差异开始,整个肿瘤届就深刻认识到中国肿瘤患者的基因变异情况和欧美人群不同。现在国家鼓励肿瘤创新疗法和创新药物的研发,只有积累起中国人自己的肿瘤大数据,才能更好地助推肿瘤创新疗法和创新药物的研发,造福我们中国的肿瘤患者可以说是国内基因测序技术的深入发展,带动了医学研究者对疾病再认识的热潮,建立基因数据库已是大势所趋。但是,尽管基因测序成本在下降,基因数据库的建设和报告分析的门槛仍较高,仍是行业发展的一个极大制约。针对这一问题,张总分享了华大基因在数据库建设方面的两点经验:其一,从技术到数据构建到数据解读甚至到后面的遗传咨询,从整个的体系建设一直到最后的应用,全都连接在一起,形成一整套的逻辑和规则;其二,从 DNA 到 RNA 到蛋白,甚至到病理、影像学,全都串在一起,为肿瘤的多维数据库来构建全面的诊断基础。张总接着对自主肿瘤数据库进行解释道,「对于一些成熟的产品(比如肺癌和一些遗传性肿瘤领域),我们已经形成了自动化分析的软件来进行整个报告解读。」未来发展目标:真智能在我国当前来看,肿瘤基因检测在市场和技术上都属于高速发展的时期,未来发展前景也为业内所看好。据张总预测,该领域未来发展的方向无外乎以下几种:首先,针对肿瘤的治疗方案,以免疫治疗为例,需要利用肿瘤基因检测技术来筛选对某一免疫治疗药物最敏感、最可能获益的人群,来施行个体化的精准治疗。其次,针对肿瘤患者的病情监测,围绕临床工作开展肿瘤患者的用药和复发的监测。再者,肿瘤的早筛。如果能在肿瘤早期(越早越好)就检测出来,那么患者的预后将得到极大的改善。肿瘤早筛应用中最关键的要求有三点,即:时间要快、效率要高、成本要低,这才能在临床上去应用。此外,最值得畅想的一点恐怕要属大数据了。无论怎样,基因测序解决不了所有的临床问题,这是肯定的。因为单一的一个技术,解决临床问题的能力都是有限的。而利用大数据模型构建,通过机器人的学习来解决传统的这种通量问题或者是单一局限性问题还是有希望的。正如张总畅想:「把 BT 和 IT 结合在一起,通过这种大数据模型形成精准的临床诊断、为医生治疗患者提供更精准的参考,我们称之为「真智能」,这肯定是一个非常明确的方向。」可以预见,「真智能」将会大大提高传统的医疗方式的效率,解放医生的时间,减少医生常规重复性劳动,为患者带来福音,作为医疗领域业内的一份子,你准备好迎接这种冲击了吗?张晓平华大基因股份有限公司 肿瘤事业部总经理,深圳华大临床检验中心主任,深圳临床分子诊断工程实验室副主任,科技部生物产业专家库评审专家。从事临床实验诊断工作近20年,有丰富的临床实验室第三方管理经验。专业方向为分子生物学、分子免疫学及基因组学。主要从事基因组学新技术临床转化应用,参与组织多项新一代测序技术临床产品开发与应用。主要方向为肿瘤多组学临床转化应用,包括基于外周血游离DNA肿瘤突变基因早期筛查、用药指导及预后监测的推广应用;具有丰富的跨组学联合实验室组织、建设、及运营管理经验。主导并完成广东省科技厅、计生委多项课题,发表包括SCI在内论文30余篇。
编辑:
翟超男

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