orange 平台cds是什么样的平台？

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2018-04-02 13:03 标签： orange 平台

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二者都是基因组注释的分析方法目的在于确定基因组序列的功能。但ORF 和 CDS 搜索软件的分析原理是不一样的

ORF的鉴定除了指定物种的遗传密码和限定最短ORF长度（默认是100）外，主要是根据起始密码和终止密码来进行搜索

而CDS（coding sequences）分析软件除了考虑上述因素，还要考虑：


1、编码序列上、下游的 grammatical structure （语法结构）如原核生物的编码序列上游通常应该有启动子。
2、编码序列以及非编码序列中使用的 nucleottide words （核苷酸语汇）例如 hexamer 语汇的差异。
总之通过CDS 分析来进┅步确定那些 ORFs 可能是真正的基因

所以ORF与CDS的结果不一致是正常的。

  • 政治敏感、违法虚假信息

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