怎么使用r软件分析简历oa系统项目经验简历分化树

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2017-06-17 05:20 标签： oa系统项目经验简历
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HIV病毒分为HIV-1和HIV-2，全世界大部分的艾滋病(AIDS)都是由前者引起的，...
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基于R的物种生态位进化分析
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R与进化生态学 —— 系统发育比较分析概述
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基于R的物种生态位进化分析 ――内容与方法 张金龙
? R与系统发育比较分析
? 进化树与物种分布模型
? 祖先性状重建
? 生态位重叠及检验
? 相应程序包 系统发育比较方法
? 随着分子生物学和生物信息学的发展，已经有众多的方法使得人们可以利用 DNA序列的异同来推断物种间的进化关系。
? 物种生态学特性各不相同，在不同尺度，通过多种生态学关系相互作用。这 些特性与生态学关系，与系统进化有何关系？
? 进化树物种的系统发育关系不同，在生态学中已经可以开始考虑。
? 系统发育比较方法（phylogenetic comparative methods）是整合进化、物种 性状、物种分布、环境因子等因素，从时间和空间尺度对物种多样性格局及 进化机制进行分析的交叉领域，是当前生态学与进化生物学研究的热点之一。 系统发育比较分析的内容
? 祖先状态重建 通过进化树每个末端分类单元的状态，推断进化树上各祖先节点的状态。
? 系统发育独立比较 如PIC
（Phylogenetic independent contrast）
? 群落系统发育结构 从物种的系统发育关系，推断群落的物种共存机制。
? 大尺度物种生态位分化 通过推断物种分布适应性的进化关系，推断大尺度物种多样性格局的成因。
? 进化过程的生态学因素 某一类群物种分化的格局及其生态学成因。 R软件系统发育分析程序包
? Phylogenetic comparative methods
? 程序包： ape 系统发育比较分析 ade4 利用欧几里得方法进行生态学数据分析 geiger 系统发育比较分析 picante 群落系统发育 phangorn 系统发育比较分析 ouch 系统发育比较分析 phyloclim 物种祖先生态位的重建及显著性检验 生态位进化分析
? 核心内容 研究气候适应性在不同分支类群中的变化及其
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